Mgr inż. Agnieszka Cecotka, Doktorant
pokój: 749
telefon: -
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
Plan zajęć

Computer Hope         

Computer Hope




Nota biograficzna:

2014 - rozpoczęcie studiów doktoranckich na kierunku Biocybernetyka i Inżyniera Biomedyczna

2014 - uzyskanie tytułu magistra inżyniera, tytuł pracy dyplomowej "Oparte na wiedzy algorytmy selekcji cech w analizie danych pozyskiwanych z wykorzystaniem wysokoprzepustowych technik pomiarowych"

2013 - uzyskanie tytułu inżyniera, tytuł projektu inżynierskiego: "Metody poszukiwania wzorców odpowiedzi komórkowej na napromienienie - analiza na przykładzie zmian proteomu w grupie myszy wsobnych o zróżnicowanym tle genetycznym"

staże naukowe:

22.04 - 03.05.2013 - kurs naukowy poświęcony tematyce: "Cellular effects of low doses and low dose-rates with focus on DNA damage and stress response" - Stockholm University, Szwecja

08.07 - 16.08.2013 - staż naukowy w Helmholtz Zentrum München, Niemcy

19.08 - 30.11.2013 - staż naukowy w Belgian Nuclear Research Centre

Rozwiń/Zwiń



Zainteresowania naukowe:

.

Lista publikacji:

1. Agnieszka Cecotka, Joanna Polanska: Region-specific methylation profiling in acute myeloid leukemia. Interdisciplinary Sciences - Computational Life Sciences, 2018, 10(1):33-42, doi: 10.1007/s12539-018-0285-4

2. Badie C., Blachowicz A., Barjaktarovic Z., Finnon R., Michaux A., Sarioglu H., Brown N., Benotmane M.A., Tapio S., Polanska J., Bouffler S.D.: Transcriptomic and proteomic analysis of mouse radiation–induced acute myeloid leukaemia (AML). Oncotarget, 2016, 7(26):40461-80, doi:10.18632/oncotarget.9626

3. Cecotka A., Polanska J.: Different methylation profiles and their alterations among gene associated and intergenic genome regions in AML. XXI Gliwice Scientific Meetings, Book of abstracts, p. 71. 17-18.11.2017, Gliwice, Poland.

4. Cecotka Agnieszka, Grainne Manning, Christophe Badie, Simon Bouffler, Joanna Polanska: Demethylation level diversification among different genome regions in human AML. Gli-wickie Spotkania Naukowe 2016, 18-19.11.2016, Gliwice, Polska, p.104 - poster

5. Cecotka A, Manning G, Badie C, Bouffler S, Polanska J: Demethylation level diversification among different genome regions in human AML, Book of Abstracts, p.104, XX Gliwice Scientific Meetings, Gliwice, November 18-19, 2016

6. Badie C, Tapio S, Barjaktarovic Z, Finnon R, Brown N, Blachowicz A, Kotas J, Polanska J, Benotmane R, Candeias S, Bouffler S: Integrated systems level analysis of myeloid leukaemogenesis and evaluation of the molecular alterations of antigenic T-cell receptor repertoire following X-irradiation. 15th International Congress of Radiation Research ICRR 2015, 25-29.05.2015, Kyoto, Japan

7. Blachowicz A, Tapio S, Barjaktarovic Z, Benotmane R, Finnon R, Badie C, Bouffler S and Polańska J: DATA DRIVEN ESTIMATION OF CUTOFFs IN SEARCHING FOR DIFFERENTIALLY EXPRESSED PROTEINS, 2015. 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2015), 12/04/2015-15/04/2015, Warsaw, Poland.

8. Blachowicz A, Tapio S, Barjaktarovic Z, Benotmane R, Finnon R, Badie C, Bouffler S, Polanska J: Does the way of induction of AML among mouse has influence on protein signature in cells? 9th Central and Eastern European Proteomics Conference CEEPC 2015, p.40, 15-18.06.2015 Poznań

9. Agnieszka Blachowicz, Christophe Badie, Simon Bouffler, Joanna Polanska, Detection of Differentially Methylated Regions of Genome in Human Leukaemias, XIX Gliwice Scientific Meetings, Book of abstracts, p. 60. 20-21.11.2015, Gliwice, Poland

10. Blachowicz A, S Tapio, Z Barjaktarovic, R Benotmane, C Badie, S Bouffler, J Polanska: Comparison study of transcriptomic and proteomic analyses of three mouse radiation induced AMLs. XVIII Gliwice Scientific Meetings, 21-22 Nov 2014, Gliwice, p.56

11. Cecotka A., Polanska J.: Zmiany poziomu metylacji DNA w różnych regionach genomu w ostrej białaczce szpikowej. Śląskie Spotkania Naukowe IV SSN, 24-25.03.2017, Ustroń, Polska, p.12

12. Blachowicz A., Manning G., Badie C., Bouffler S., Polanska J.: Detekcja regionów promotorowych genów o profilu metylacji istotnie różniącym osoby zdrowe i cierpiące na AML. Śląskie Spotkania Naukowe, 3-4.06.2016, Dzierżno

13. Blachowicz A: Analiza wieloplatformowa biomarkerów białaczki indukowanej promieniotwórczością. Śląskie Spotkania Naukowe, Szczyrk 24-26.10.2014

14. Cecotka A., Polanska J.: Novel Method of Identifying DNA Methylation Fingerprint of Acute Myeloid Leukaemia. In: Fdez-Riverola F., Mohamad M., Rocha M., De Paz J., Pinto T. (eds) 11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics. PACBB 2017. Advances in Intelligent Systems and Computing, vol 616. pp 189-196, (2017) Springer, Cham ISBN:978-3-319-60815-0